Das Europäische Parlament hat den Generalsekretär des SRU, Dr. Christian Hey, in den Verwaltungsrat der Europäischen Umweltagentur berufen. Er wird dort Stellvertreter des ehemaligen Präsidenten des Wuppertal-Instituts, Prof. Dr. Peter Hennicke.
Der Verwaltungsrat ernennt den Direktor der Europäischen Umweltagentur und genehmigt die Arbeitsplanung und das Budget. Er besteht aus Vertretern der Mitgliedsstaaten, der Europäischen Kommission und zwei vom Europäischen Parlament ausgewählten Wissenschaftlern, die laut Einrichtungsverordnung der EEA „besonders qualifiziert“ sind, einen „persönlichen Beitrag zur Arbeit der Europäischen Umweltagentur zu leisten“.